乃旦寺位于昌都类乌齐县加桑区雨扎乡乌入村东南约二百米高的山上，寺庙四面山峦遍布着葱绿的树木，吉曲河水西流，景色宜人。“乃旦”在藏语中为罗汉之意，因北面的多宗山犹如十六尊罗汉而得名。

乃旦寺由大伏藏掘藏师觉久林巴建于1820年，建筑风格为藏式平项式，寺内还供奉有《甘珠尔》和《丹珠尔》二经以及旧唐卡50多幅。整座寺庙具有独特的艺术风格，对研究红教发展提供了珍贵的历史资料。